Fingerprint molecular de porta-exertos de citros via marcadores (ISSR) inter-simple sequence repeats

Abstract

O estudo teve por objetivo determinar o perfil molecular apresentado pelos principais híbridos de porta-enxertos (PEs) de citros da Embrapa Mandioca e Fruticultura, resultantes do Programa de Melhoramento Genético da Embrapa. Cada fingerprint particular foi gerado por um conjunto de primers obtidos a partir de marcadores ISSR. Para isto, fez-se a extração e quantificação de DNA de folhas jovens de 28 PEs de citros, seguida da amplificação com 6 primers ISSR (TrICAC3‟YC, TriGTG3‟YC, TriTGT5‟CY, TriTGT5‟ CR, TriACA3‟ RC, TriACG3‟ RC), cujos fragmentos foram visualizados em gel de agarose 2,5%. Posteriormente, o perfil eletroforético desses primers selecionados foi visualizado através da reação por capilar, no equipamento Fragment Analyzer. Desta forma, obteve-se um padrão de bandas apresentadas pelos primers ISSR para todos, permitindo caracterizar o grupo de genótipos. As melhores marcas foram selecionadas pelo software GENES, onde observou-se maior aplicabilidade dos primers TrICAC3‟YC, TriGTG3‟YC, TriTGT5‟CY para o estudo de fingerprint, sendo o último mais indicado por ter gerado maior número de marcas selecionadas. Assim, pode-se comprovar a aplicabilidade do marcador ISSR para caracterização deste grupo de genótipos de citros, sendo o primer TriTGT5‟CY o mais indicado para o estudo do fingerprint desse grupo de genótipos. _____________________________________________________________________________________ The study aimed to determine the molecular profile of the main citrus rootstock hybrids developed by Embrapa Cassava and Fruits. Each particular fingerprint was generated by a set of ISSR primers. DNA was extracted from 28 citrus rootstocks (CR) and quantified and followed by the amplification of 6 ISSR primers (TrICAC3'YC, TriGTG3'YC, TriTGT5'CY, TriTGT5 'CR, TriACA3' RC, TriACG3 'RC) in a 2.5% agarose gel. Subsequently, the electrophoretic profile of the 28 CR was visualized by capillaries in the Fragment Analyzer equipment. A pattern of bands presented by the ISSR primers for all individuals was obtained, enabling the characterization of the genotypes. The best bands were selected by the GENES software, where there was greater applicability of primers TrICAC3'YC , TriGTG3'YC and TriTGT5'CY in the study of the fingerprint, whereas primer TriTGT5'CY was considered more appropriate since it presented a greater number of selected bands. Therefore, it was possible to demonstrate the applicability of the ISSR markers for characterization of this group of CR whereas primer TriTGT5'CY was the most suitable for the study of the fingerprint of all CRs analyzed together.